Africké vodní lilie jsou konzumovány řadou organismů včetně hrochů, manateů, vodního buvolu, slona, ryb a řady obojživelníků a druhů plazů. Určité části rostliny mohou také konzumovat hmyz, jako jsou vodní brouci a weevily. Zejména druhy ryb, jako je tilapie a africké lungfisty, se aktivně pasou na vodních liliích a hrají důležitou roli při kontrole populace. Nakonec některé druhy ptáků, jako jsou kachny, mohou konzumovat semena a jiné rostlinné části.
