Netopýři dýchají jako savci. Mají plíce a membránu, stejně jako lidé a jiní savci, a dýchají vzduch dovnitř a ven ústy a nosy. Ptáci mají jiný respirační systém, který zahrnuje plíce, vzduchové vaky a syrinx, a dýchají vzduch dovnitř a ven skrz jejich zobáky.
