1. konvergentní evoluce :K konvergentnímu vývoji dochází, když nesouvisející druhy vyvíjejí podobné vlastnosti nezávisle, často v reakci na podobné environmentální tlaky. Například efektivní tvar těla delfínů a ryb se v obou skupinách vyvinul nezávisle jako adaptace pro účinný pohyb ve vodě. Navzdory jejich podobnému vzhledu jsou delfíni savci, zatímco ryby jsou obratlovci a patří do různých evolučních linií.
2.. sdílené rysy předků :Některé druhy mohou sdílet určité vlastnosti kvůli společnému původu, i když se následně rozlišovaly a získaly odlišné vlastnosti. Například netopýři a ptáci mají křídla, ale netopýři jsou savci, zatímco ptáci jsou plazi. Přítomnost křídel v obou skupinách naznačuje sdílenou evoluční historii.
3. molekulární důkazy :Genetická analýza, jako je sekvenování DNA, může odhalit skutečné evoluční vztahy mezi druhy. Porovnáním sekvencí DNA mohou vědci určit stupeň genetické podobnosti mezi různými druhy a odvodit jejich evoluční vztahy. Důkazy DNA mohou odhalit blízké genetické vztahy i mezi druhy, které se objevují velmi odlišné morfologicky.
4. adaptivní záření :Adaptivní záření nastává, když jediný druh předků vyvolává řadu různých druhů s odlišnými morfologiemi a adaptací. Příkladem jsou Finches Darwina na ostrovech Galapagos, kde se různé druhy Finch vyvinuly různé tvary zobáku, aby využily specifické zdroje potravy. Navzdory jejich variacím ve struktuře zobáku sdílejí tyto finche společný předchůdce a jsou úzce spjaty.
Proto je možné, aby dva druhy vypadaly velmi odlišně od sebe navzájem, aby byly těsněji příbuznější než podobné jiným druhům kvůli faktorům, jako je konvergentní evoluce, sdílené předkové rysy, molekulární důkazy a adaptivní záření.