Hnědé pelikáni, stejně jako všichni obratlovci, mají endoskelet. Endoskelet je vnitřní rámec kostí, který poskytuje podporu a ochranu těla a jeho orgánů. Naproti tomu exoskeleton je vnější skořápka nebo krytí, které poskytuje podporu a ochranu, jak je vidět u členovců, jako je hmyz a korýši.
