1. Jeskyně a podzemní prostory:
Jeskyně a podzemní prostory poskytují ideální místy pro netopýry. Nabízejí temnotu, konstantní teploty a ochranu před dravci a drsnými povětrnostními podmínkami. Mnoho druhů netopýrů tvoří velké kolonie uvnitř jeskyní a visí vzhůru nohama od stropu nebo stěn. Jeskyně s vhodnými mikroklimami, jako je stabilní teplota a vlhkost, jsou zvláště atraktivní pro netopýry.
2. Lesy:
Netopýři běžně obývají lesy, ať už tropické nebo mírné. Využívají stromy pro hnízdění, potravu a navigaci. Některé druhy stromů, jako jsou vyhloubené staré stromy nebo stromy s volnou kůrou, poskytují netopýři vhodných prostorů, které se mohou během dne rozvinout. Lesy nabízejí rozmanitou populaci hmyzu a slouží jako bohatý zdroj potravy pro hmyzí netopýry.
3. Městské oblasti:
Překvapivě se mnoho druhů netopýrů přizpůsobilo životu v městském prostředí. Městské oblasti poskytují místy roostingu v budovách, mostech a dokonce i pod okapy domů. Některé druhy se naučily využívat umělé světelné zdroje pro hledání potravy, kde se shromažďuje hmyz přitahovaný ke světlu. Městské oblasti však mohou pro netopýry představovat výzvy, protože mohou čelit rizikům, jako je ničení stanovišť, znečištění světla a kolize s budovami.