Největším zranitelností orla bělohlavého orel je selhání hnízda, ke kterému může dojít z různých důvodů, včetně extrémních povětrnostních událostí, predace jiných zvířat, nemoci, poruch člověka a kontaminace životního prostředí, zejména těžkými kovy, plastikami, pesticidy a dalšími chemikáliemi.
