Trpasličí křečky, stejně jako většina ostatních druhů hlodavců, mají vlastní averzi k vodě. Voda může být pro trpasličí křečky nebezpečím, protože jejich malá velikost je činí náchylnými k rychlým změnám v jejich tělesné teplotě. Mokré kožešiny a dlouhodobé vystavení vody mohou vést k podchlazení, což je život ohrožující stav. Zatímco trpasličí křečky se přirozeně ženicha a instinktivně vyhýbají přímému kontaktu s velkými vodními útvary, mohou tolerovat koupání v malém množství písku pro rychlé čištění. Je však třeba se vyhnout nucenému nebo prodlouženému ponoření do vody, aby se zajistilo pohodu a bezpečnost křečka.
