* Protozoa :Protozoa jsou rozmanitou skupinou jednobuněčných organismů, které se vyskytují ve všech typech stanovišť, včetně půdy, vody a dokonce i lidského těla. Živí se jinými mikroorganismy a hrají důležitou roli v potravinovém řetězci. Mezi běžné příklady mikroskopického protozoa patří améby, parametry a Euglena.
* bakterie :Bakterie jsou jednobuněčné mikroorganismy, které se vyskytují téměř v každém prostředí na Zemi. Přicházejí v celé řadě tvarů a velikostí a hrají klíčovou roli v rozkladu organické hmoty, fixace dusíku a produkci kyslíku. Mezi běžné příklady mikroskopických bakterií patří E. coli, Bacillus subtilis a Staphylococcus aureus.
* Fungi :Houby zahrnují kvasinky, formy a masité houby. Mezi mikroskopické houby patří Aspergillus, Penicillium a Candida.
* microinvertebrates :Mikroinvertebraty jsou mikroskopická zvířata, která zahrnují rotify, nematody a tardigrady.
* Plankton :Plankton je rozmanitá skupina mikroskopických organismů, které žijí ve vodě. Mezi příklady planktonu patří rozsivky, dinoflageláty a copepods.