1. Indiana Bat (Myotis Sodalis):Indiana Bat je malá hnědá netopýra, která je federálně uvedena jako ohrožená. Obýtí jeskyně a zalesněné oblasti v parku. V důsledku ztráty stanovišť a syndromu bílého nosu, smrtelného onemocnění plísňů, které postihuje hibernační netopýry, se populace netopýrů Indiana výrazně snížila.
2. Gray Wolf (Canis Lupus):Šedý vlk byl historicky přítomen v oblasti Velkých kouřových hor, ale byl eradikován počátkem 20. století kvůli lovu a pronásledování. Probíhá úsilí o zavedení šedého vlka do parku s potenciálními výhodami pro obnovu ekosystému a dynamiku predátorské kořisti.
3. Elk (Cervrus Canadensis):Elk byl kdysi hojný ve velkých kouřových horách, ale čelili populaci klesat v důsledku přesunu. V roce 2001 byli znovu zavedeni do parku a od té doby založili malou, ale rostoucí populaci. Elk jsou považováni za klíčový druh, protože jejich pastvní chování ovlivňuje rostlinné komunity a poskytuje stanoviště pro jiné divoké zvěře.
4. Virginie Northern Flying Squirrel (Glaucomys Sabrinus fuscus):Tento poddruh severní létající veverky je endemický do jižních Appalachianských hor, včetně velkých kouřových hor. Je federálně ohrožena kvůli faktorům, jako je ztráta a roztříštěnost stanovišť. Úsilí o ochranu se zaměřuje na ochranu svých zbývajících stanovišť a řešení hrozeb.
5. Appalachian Trail Pupfish (Cyprinodon Vernalis):Appalachian Trail Pupfish je malá ryba nalezená v izolovaných horských potokech v parku. Je uvedena jako ohrožená kvůli jeho omezenému rozsahu a zranitelnosti vůči degradaci stanovišť a změně klimatu.
Ochrana a zachování ohrožených druhů je životně důležitým aspektem mise národního parku Velké kouřové hory zachovat jeho bohatou biologickou rozmanitost. Pro zajištění přežití těchto zranitelných druhů jsou prováděna různá opatření na ochranu přírody, včetně správy stanovišť, monitorovacích programů a vzdělávacích iniciativ.