1. Odpady ze zažívacího traktu: Poté, co želvy přijmou a stráví potravu, nestrávený materiál se hromadí v jejich střevech.
2. Tvorba výkalů: Střeva absorbují vodu a živiny z potravy a zbývající odpad ztuhnou na výkaly.
3. Uložení v konečníku: Vytvořené výkaly jsou dočasně uloženy v konečníku, což je konečný úsek tlustého střeva.
4. Vylučování: Když se konečník naplní nebo v pravidelných intervalech, želva vypudí výkaly kloakou.
5. Vylučování močí: Kromě trusu vylučují želvy kloakou dusíkaté odpadní produkty především ve formě kyseliny močové. Ledviny filtrují odpad z krevního řečiště a močovody transportují moč do kloaky k vyloučení.
6. Úložiště močového měchýře (některé želvy): Některé druhy želv mají močový měchýř, který uchovává moč před tím, než je vypuzena kloakou.
Stojí za zmínku, že frekvence vylučování se může u jednotlivých druhů želv lišit a může být ovlivněna faktory, jako je strava, podmínky prostředí a zdraví jednotlivce.