Trilobiti: Tito vyhynulí mořští členovci jsou široce rozšířeni v Pyrenejích. Dařilo se jim během paleozoické éry, od období kambria po období devonu. Fosilie trilobitů lze nalézt na mnoha místech, například v kambrických břidlicích poblíž Gavarnie ve Francii a v ordovických vápencích v oblasti Vallibierna ve Španělsku.
Amoniti: Amoniti jsou vyhynulí hlavonožci, příbuzní novodobým chobotnicím a sépím. Běžně se vyskytují v druhohorních horninách Pyrenejí, zejména v období jury a křídy. Zkamenělé amonity lze pozorovat ve vápencích a opukách na místech, jako je Col de Ares ve Francii a Sierra del Montsec ve Španělsku.
Echinoidi (mořští ježci): Echinoidi jsou mořští bezobratlí s ostnatými lasturami. Jejich fosilie jsou rozšířeny v Pyrenejích, od prvohor až po třetihorní období. Lze je nalézt v mělkých mořských nalezištích, jako jsou křídové vápence v oblasti Roncal ve Španělsku.
Rudističtí mlži: Rudističtí mlži byli hojní v období pozdní křídy. Jsou velké a často bizarního tvaru a v některých oblastech Pyrenejí tvoří útesové struktury. Zkamenělé rudisty lze pozorovat v lokalitách, jako je Gavarnie Gorge a oblast Luz-Saint-Sauveur ve Francii, stejně jako v národním parku Ordesa a Monte Perdido ve Španělsku.
Nummulity: Nummulity jsou vyhynulé jednobuněčné foraminifery, které žily v teplých mělkých mořích. Fosilie numulitů jsou běžné v eocénních vápencích v pyrenejské oblasti, zejména v oblasti Hecho ve Španělsku a oblasti kolem Pau a Mauléonu ve Francii.
Oligocenní savci: Pyreneje také poskytly důležité zkameněliny savců z epochy oligocénu, jako jsou pozůstatky raných primátů, hlodavců a masožravců, což poskytuje pohled na raný vývoj těchto skupin.
To je jen několik příkladů rozmanitých fosilií nalezených v Pyrenejích. Složitá geologická historie a environmentální podmínky pohoří vedly k bohatému a důležitému paleontologickému dědictví, které nadále přitahuje vědce a výzkumníky z celého světa.