Genetická výbava ligrů je složitá, protože dědí vlastnosti od lvů i tygrů. To může vést ke konfliktům ve vývoji jejich reprodukčních orgánů, což vede k neplodnosti. Kromě toho se liší počty chromozomů lvů a tygrů, což může dále narušit správné fungování reprodukčního systému.
Dalším faktorem přispívajícím k neplodnosti ligerů je nedostatek genetické diverzity v hybridní populaci. Ligři jsou často výsledkem jednorázového páření mezi lvy a tygry, spíše než kontinuálního chovného programu. To znamená, že v populaci ligerů existuje omezený fond genetických variací, což může snížit jejich šance na produkci plodných potomků.
I když se vyskytly vzácné případy plodných ligrů, tyto případy jsou velmi neobvyklé a naprostá většina ligrů je neplodná. Tato neplodnost je přirozený jev, který brání křížení různých druhů a pomáhá udržovat genetickou integritu každého druhu.