Savannah kočky, stejně jako všechny domácí kočky, mají 38 chromozomů .
Toto je stejný počet chromozomů jako typická domácí kočka. Rozdíl ve vzhledu a charakteristikách mezi kočkou Savannah a domácí kočkou pochází z genů, které jsou prováděny na těchto chromozomech, nikoli o počtu samotných chromozomů.