Zatímco specifické geny odpovědné za heterochromii nejsou zcela pochopeny, předpokládá se, že je spojeno s distribucí melaninu , pigment odpovědný za barvu očí během vývoje plodu.
Je důležité si uvědomit, že heterochromie je normální variace a ne zdravotní problém. Neovlivňuje to vizi kočky nebo celkové zdraví.