Chromozom Y obsahuje gen zvaný SRY gen, který kóduje protein, který je nezbytný pro vývoj mužů. SRY gen je umístěn na krátkém rameni chromozomu Y a je přítomen u všech mužů, ale ne u žen.
Když je zapnutý gen SRY, spustí kaskádu událostí, které vede k vývoji mužských reprodukčních orgánů. Tyto události zahrnují tvorbu varlat, produkce testosteronu a diferenciace vnějších genitálií na mužské struktury.
Při absenci genu SRY se embryo vyvine na ženu. Je to proto, že ženský reprodukční systém je výchozí vývojovou cestou pro embrya. U žen se vaječníky vyvíjejí a produkují estrogen a vnější genitálie se rozlišují na ženské struktury.