Tady je důvod:
* morfologické podobnosti: Choanoflageláty sdílejí pozoruhodné podobnosti s límečkovými buňkami (choanocyty) nalezenými v houbách, nejjednodušších zvířatech. Oba mají jediné bičíky obklopené límcem mikrovilli, které se používají k filtrování potravin z vody.
* Genetické důkazy: Molekulární analýza genů ribozomálních RNA silně podporuje úzký vývojový vztah mezi choanoflageláty a zvířaty. Sdílejí jedinečnou sadu genů, které nebyly nalezeny u jiných protistů.
* potenciální předchůdce: Obecně se věří, že předchůdce podobný choanoflagelátu dal zvířata.
Zatímco jiným protistům, jako jsou Amoebozoans, se navrhovalo, aby v minulosti úzce souviseli se zvířaty, důkazy převážně poukazují na Choanoflagellates jako nejbližší žijící příbuzné.