Když však více Evropanů začalo navštěvovat Mauricius a okolní ostrovy, populace Dodo začala klesat. V polovině 17. století byl Dodo zaniklý.
Vyhynutí dodo bylo do značné míry způsobeno lidskou činností. Holandští osadníci, kteří dorazili na Mauricius v 16. století, představili na ostrov prasata, psy a kočky. Tato zvířata se pohybovala na vejcích a mladých dodo a také soutěžila s Dodo o jídlo. Holandští námořníci navíc často lovili dodo pro jídlo a pro své peří.
Než začali vědci studovat Dodo, už to bylo zaniklé. V důsledku toho se museli spoléhat na účty raných evropských průzkumníků a na několik přežívajících exemplářů peří a kostí Dodo. Tyto exempláře nebyly příliš poučné a vědci zůstali s velmi omezeným porozuměním Dodo.
Na konci 20. století zahájil tým vědců vedený Dr. Julianem Hume novou studií Dodo. K rekonstrukci vzhledu a chování Dodo použili řadu technik, včetně počítačového modelování a analýzy DNA. Jejich výzkum odhalil, že Dodo byl mnohem složitější a zajímavější pták, než se dříve myslelo.
Dodo je nyní považováno za ikonu vyhynutí. Je to připomínka křehkosti ekosystémů naší planety a důležitosti ochrany ohrožených druhů.