* vysoké náklady: Nastavení a údržbu programů chovu v zajetí mohou být nákladné. To zahrnuje náklady na zařízení, vybavení, zaměstnance a jídlo.
* Nedostatek genetické rozmanitosti: Programy šlechtění v zajetí mohou vést k nedostatku genetické rozmanitosti, což může být populace zranitelnější vůči nemocem a jiným hrozbám.
* Zvýšené riziko nemoci: Zajatelná zvířata jsou často náchylnější k nemoci než divoká zvířata, protože nejsou vystavena stejným přirozeným výzvám.
* nepřirozené chování: Zajatá zvířata mohou vykazovat nepřirozené chování, protože nejsou schopna žít ve svém přirozeném prostředí. To může vést ke stresu a dalším zdravotním problémům.
* etické obavy: Někteří lidé se domnívají, že programy chovu v zajetí jsou neetické, protože zahrnují převzetí zvířat z jejich přirozeného stanoviště a udržování je v zajetí.
Celkově mohou být programy chovu v zajetí užitečným nástrojem pro zachování ohrožených druhů, ale mají také řadu nevýhod. Je důležité pečlivě zvážit výhody a nevýhody, než se rozhodne, zda zahájit nebo ne zahájit program chov v zajetí.