Odhaduje se, že na světě je asi 1 300 druhů netopýrů, přičemž populace se velmi liší v závislosti na druhu a regionu. Některé druhy, jako je běžná netopýr Pipistrelle (Pipistrellus Pipistrellus), jsou rozšířené a hojné, zatímco jiné, jako jsou Rodrigues Fruit Bat (Pteropus Rodricensis), jsou kriticky ohroženy a mohou mít zbývající méně než 10 jednotlivců.
Abychom získali přesnější odhad celkového počtu netopýrů na světě, bylo by nutné provést komplexní průzkum populace netopýrů v každé zemi a regionu. To by byl náročný a časově náročný úkol, protože netopýři je často obtížné odhalit a počítat. Takový průzkum by však poskytl cenné informace o stavu populace netopýrů a pomohl by informovat úsilí o ochranu.