1. Nedostatek jasné definující charakteristiky:
* zvířata: Zvířata sdílejí společný předchůdce a vykazují jasné definující charakteristiky, jako je mobilita, heterotrofní výživa (spotřeba jiných organismů) a komplexní nervový systém.
* rostliny: Rostliny jsou neuvěřitelně rozmanité a nesdílejí ani jeden, všeobecně definující charakteristiku. Vykazují širokou škálu adaptací, včetně různých fotosyntetických mechanismů, reprodukčních strategií a růstových forem.
2. Konvergentní vývoj:
* zvířata: Evoluce zvířat často zahrnuje přechod do různých skupin s jedinečnými adaptacemi.
* rostliny: Rostliny se často vyvíjejí podobné rysy nezávisle kvůli podobným tlakům na životní prostředí. Tento jev, nazývaný konvergentní evoluce, je náročné rozlišovat mezi úzce příbuznými skupinami na základě samotného vzhledu. Například Cacti a Euphorbs sdílejí ošetřené funkce a sukulentní stonky, ale nejsou úzce související.
3. Rozsáhlá hybridizace:
* zvířata: Zatímco k hybridizaci dochází u zvířat, je to méně běžné a obvykle vede k odlišným druhům s jedinečnými charakteristikami.
* rostliny: Hybridizace je v rostlinách rozšířená a vytváří variační kontinuum a rozmazává linie mezi druhy. To ztěžuje definování hranic druhů na základě samotné morfologie.
4. Důležitost molekulárních dat:
* zvířata: Tradiční morfologická klasifikace je pro zvířata často dostatečná kvůli jejich jasným charakteristikám a odlišným evolučním liniím.
* rostliny: Molekulární data (Analýza DNA) jsou stále důležitější pro pochopení vztahů rostlin v důsledku prevalence konvergentního vývoje a hybridizace.
5. Historické faktory:
* zvířata: Klasifikace zvířat má delší historii a zavedenější rámec kvůli jejich větší viditelnosti a zjevnějším rozdílů.
* rostliny: Klasifikace rostlin čelí více výzvám kvůli jejich rozmanitosti, kryptické povaze a historickému spoléhání se pouze na morfologické rysy.
Celkově jsou rostliny náročnější skupinou klasifikovat kvůli jejich komplexní evoluční historii, rozsáhlé konvergenci, hybridizaci a potřebě molekulárních dat k vyřešení vztahů. Tato složitost zdůrazňuje pokračující práci a význam taxonomie rostlin při porozumění biologické rozmanitosti a evolučních procesech.