Netopýři obývají úžasnou rozmanitost prostředí po celém světě a prokazují jejich pozoruhodnou přizpůsobivost. Jejich stanoviště sahají od svěžích, vlhkých deštných pralesů Jižní Ameriky až po vyprahlé pouštní krajiny Austrálie a mírných lesů Severní Ameriky. Netopýři najdete také v jeskyních a podzemních komorách, které jim nabízejí svatyni od predátorů a prvků. Některé druhy dávají přednost přebývání v městském prostředí, včetně zákoutí a lebky budov a mostů. S výjimkou extrémních polárních oblastí lze netopýři nalézt na všech kontinentech, prosperující v různých podnebích a ekosystémech. Jejich schopnost navigovat v různých stanovištích pomocí jejich echolokačních schopností jim umožňuje využívat hojné zdroje potravy a úspěšně se hýbat a vychovávat mladé.