Koně mohou mít alergie jako lidé. Jednou z běžných alergií na koně je alergie na kousnutí hmyzu, například od komárů, mouchy nebo komárů. Tyto kousnutí mohou způsobit reakci zvanou hypersenzitivita kousnutí hmyzu, která se může pohybovat od mírného svědění až po závažné otoky a nepohodlí. Jiné alergie na koně mohou zahrnovat alergie na určitá jídla, jako jsou luštěniny nebo tráva, environmentální alergeny, jako je pyl nebo plísně, a dokonce i některé léky nebo výrobky pro péči. Alergie u koní mohou být léčeny různými metodami, jako je vyhýbání se alergenům, použití antihistaminika nebo imunoterapie, která zahrnuje postupné zavádění alergenu v malých dávkách, aby se snížila citlivost.