Znečištění: Znečištění, včetně úniků ropy, vypouštění z odpadních vod, dešťové vody a zemědělského odpadu, může udusit korálové útesy, blokovat sluneční světlo a bránit růstu korálů. Chemikálie mohou otrávit mořský život a mohou mít negativní dopad na růst korálů a reprodukční úspěch ryb. Odtok z hnojiv a pesticidů používaných v zemědělství může vést k výkvětům řas, které dusí korálové útesy a narušují rovnováhu ekosystému potravinového řetězce.
Změna klimatu: Rostoucí teploty oceánů v důsledku globálního oteplování mohou vybělit a zabít korály a extrémní jevy počasí, jako jsou hurikány a tajfuny, mohou zničit korálové útesy. Hrozbou pro korálové útesy je i acidifikace, což je snížení hladiny pH v oceánu v důsledku absorpce oxidu uhličitého. Okyselení oceánů ztěžuje korálům stavbu a údržbu jejich koster, což může vést ke kolapsu korálových útesů.
Nadměrný rybolov může narušit potravní řetězec a snížit počet predátorů, kteří ovládají populaci býložravců. To může vést ke zvýšení počtu býložravců, kteří mohou poškodit útes pasením se na korálech. Nadměrný rybolov může také vést k přímému ulovení žab jako zdroje potravy.
Vedlejší úlovek: Žabiny mohou být neúmyslně chyceny do rybářských sítí a trawlerů, což může vést k jejich smrti.
Cestovní ruch: Nekontrolovaný turismus může vést k pošlapání korálových útesů a zničení biotopu žabích ryb. Potápěči a šnorchlaři mohou také shodit kotvy na korálových útesech, což je může poškodit.