Galapágští tučňáci jsou endemičtí na Galapágských ostrovech, díky čemuž jsou geograficky izolovaní od ostatních druhů tučňáků a jejich přežití závisí na jedinečném ekosystému souostroví. Jejich populace je relativně malá, odhadem zbývá 1 200–2 000 jedinců. Tato omezená velikost populace je činí náchylnějšími k různým hrozbám a změnám životního prostředí.
2. Ztráta a degradace biotopů
Galapágy jsou oblíbenou ekoturistickou destinací a zvyšující se přítomnost lidí vedla ke ztrátě a degradaci stanovišť. Výstavba turistických zařízení, zavádění invazních druhů, zvýšené znečištění a vyrušování lidskou činností negativně ovlivnily hnízdiště a krmiště tučňáků.
3. Změna klimatu
Galapágy jsou velmi zranitelné vůči klimatickým změnám, zažívají stoupající hladiny moří, změny oceánských proudů a zvýšenou frekvenci a intenzitu extrémních povětrnostních jevů. Tyto změny narušují křehkou rovnováhu mořského ekosystému a ovlivňují dostupnost potravinových zdrojů, jako jsou ryby a krill, na kterých jsou tučňáci závislí. Oteplování oceánů může také přímo stresovat tučňáky a ovlivnit jejich reprodukční úspěch.
4. Nadměrný rybolov a konkurence
Nadměrný rybolov malých pelagických ryb, které jsou primární kořistí tučňáků z Galapág, snižuje jejich dostupnou potravu. Navíc konkurence o zdroje potravy s jinými mořskými predátory, jako jsou lachtani a větší druhy ryb, může dále omezit přístup tučňáků k obživě.
5. Nemoci a paraziti
Galapágští tučňáci jsou náchylní k různým nemocem a parazitům, včetně ptačích neštovic, ptačí malárie a střevních parazitů. Tyto nemoci se mohou v populaci tučňáků rychle šířit a způsobit vysokou úmrtnost, zejména mezi kuřaty a mláďaty.
6. Predace
Zavlečení nepůvodních predátorů, jako jsou kočky, krysy a psi, na Galapágy představuje pro tučňáky významnou hrozbu. Tito predátoři loví vejce tučňáků, kuřata a dokonce i dospělé tučňáky, což přispívá k poklesu jejich populace.