Bycatch :Primární hrozbou pro Baiji je náhodné zachycení (vedlejší úcty) v rybářských sítích. Rybolov pro porpoises bez ploutve a další vodní druhy v řece Yangtze se v posledních několika desetiletích výrazně zvýšil. Vzhledem k zmenšené velikosti populace Baiji a omezenému rozsahu ve spodním dosahu Yangtze existuje větší šance, že jednotlivci budou chyceni v rybářském vybavení.
Degradace stanoviště :Řeka Yangtze je jednou z nejvíce znečištěných řek na světě a toto znečištění má devastující dopad na Baijiho stanoviště. Řeka je domovem široké škály znečišťujících látek, včetně těžkých kovů, pesticidů a léčiv. Tyto znečišťující látky mohou způsobit řadu zdravotních problémů u delfínů, včetně rakoviny, reprodukčních problémů a dysfunkce imunitního systému. K degradaci stanovišť navíc přispěla výstavba přehrad a dalších vodních projektů podél řeky Yangtze.
Lov :Ačkoli čínská vláda zakázala lov delfínů Baiji, stále dochází k nelegálnímu lovu. Delfíni jsou loveni pro své maso, které je v některých částech Číny považováno za pochoutku. Jsou také loveni pro svůj olej, který se používá v tradiční čínské medicíně.
Kumulativní účinky těchto hrozeb vedly k rychlému poklesu Baijiho populace. V 80. letech bylo v řece Yangtze odhadem 400 delfínů Baiji. Koncem roku 2000 se populace odmítla na pouhých 18 jednotlivců. V roce 2016 byl delfín Baiji vyhlášen funkčně zaniklý, protože od roku 2002 nebyla provedena žádné potvrzené pozorování druhu.