1. Skeleton: Kostnaté ryby mají kostru vyrobenou z kostí, zatímco chrupavkové ryby mají kostru vyrobenou z chrupavky. Chrupavka je flexibilní, nemineralizovaná pojivová tkáň, zatímco kost je tvrdá, mineralizovaná tkáň.
2. Směry: Kostnaté ryby mají stupnice vyrobené z kosti nebo modifikované kosti, zatímco chrupavkové ryby mají stupnice vyrobené z materiálu zvaného placoid. Měřítka placoidu jsou malé struktury podobné zubům, které jsou zabudovány do kůže.
3. Plouty: Kostnaté ryby mají ploutve, které jsou podporovány kostnatými paprsky, zatímco chrupavkové ryby mají ploutve, které jsou podporovány chrupavkovými paprsky.
4. Gills: Kostnaté ryby mají žábry, které jsou pokryty kostnatým operculum, zatímco chrupavkové ryby mají žábry, které nejsou pokryty operculum.
5. Zuby: Kostnaté ryby mají zuby, které se nacházejí v jejich čelistech, zatímco chrupavkové ryby mají zuby, které se nacházejí na jejich čelistech a gillové oblouky.
6. Oči: Kostnaté ryby mají oči, které se nacházejí po stranách hlavy, zatímco chrupavkové ryby mají oči, které se nacházejí na vrcholu jejich hlavy.
7. Nostril: Kostnaté ryby mají dvě nosní dírky, zatímco chrupavkové ryby mají jednu nosní dírku.
8. Spiracles: Kostnaté ryby nemají spirály, zatímco chrupavkové ryby mají spirály, které jsou malé otvory na horní části jejich hlavy, které umožňují vodě proudit do jejich žábrů.
9. Caudal Fin (Tailfin): Kostnaté ryby mají kaudální ploutev, která je symetrická, což znamená, že je to stejný tvar na obou stranách, zatímco chrupavkové ryby mají kaudální ploutev, která je asymetrická, což znamená, že na obou stranách jsou různé tvary.