- colugo :Také známí jako létající lemury, tito savci klouže vzduchem pomocí patagia, membrány, která se táhne mezi jejich končetinami. Philippine Eagles se zaměřuje na Colugos jako hlavní část jejich stravy.
- obří létající veverka :Tyto velké veverky jsou arboreal, žijí ve stromech. Slouží jako další zdroj potravy pro filipínské orly.
- Philippine Macaque :Tento typ opice je původem z Filipín a tráví většinu času ve stromech, takže je zranitelná vůči predaci filipínským orlem.
- Ostatní savci :Filipínští orli mohou také občas lovit krysy, netopýry a další malé savce, kteří obývají lesy.
Stojí za zmínku, že filipínští orli jsou predátoři vrcholu, což znamená, že jsou na vrcholu potravinového řetězce a nemají žádné přirozené predátory. Jejich lovecká zdatnost a mocné drápy jim umožňují efektivně zachytit a zabíjet svou kořist, což z nich činí jeden z nejúžasnějších kořisti ptáků na světě.