2. Pytláctví a lov: Bonobové jsou loveni pro maso a někdy i pro nelegální obchod se zvířaty. Obchod s křovinatým masem představuje vážnou hrozbu, protože bonobové jsou zabíjeni pro maso a prodáváni na místních trzích.
3. Přenos nemocí z lidí: Blízkost k lidské populaci může také ovlivnit bonoby kvůli přenosu nemocí. Infekční onemocnění, jako jsou respirační infekce a virus Ebola, mohou být smrtelné pro lidoopy, včetně bonobů.
4. Omezený rozsah: Bonobové mají relativně malý přirozený areál výskytu ve srovnání s jinými druhy lidoopů, omezený především na povodí Konga v Demokratické republice Kongo. Tento omezený rozsah je činí zranitelnějšími vůči dopadům ztráty přirozeného prostředí, pytláctví a vyrušování lidmi akutněji.
5. Pomalá rychlost reprodukce: Bonobové, stejně jako ostatní velcí lidoopi, mají dlouhou životnost, ale pomalou reprodukční rychlost. To znamená, že jejich populace se pomalu zotavují z dopadů lovu, nemocí nebo ztráty stanovišť, což zvyšuje jejich riziko ohrožení.
6. Nedostatek informovanosti: Až donedávna bylo bonobům věnováno méně pozornosti a zdrojů ochrany než jiným druhům lidoopů. Tato nedostatečná informovanost a stanovení priorit přispěly k jejich zranitelnému postavení.
Prostřednictvím ochranářských organizací, chráněných oblastí, opatření proti pytláctví a zvyšování povědomí o ochraně zbývajících populací bonobo a zachování jejich přirozeného prostředí se vyvíjí úsilí. Pokračující hrozby a politická nestabilita v Demokratické republice Kongo však činí ochranu bonobo náročným úsilím.