Lov a pytláctví: Přestože jsou floridští panteři chráněni zákonem o ohrožených druzích, stále čelí hrozbě nelegálního lovu a pytláctví. Někteří lidé zabíjejí pantery pro jejich kožešinu nebo jako odplatu za domnělé hrozby pro hospodářská zvířata.
Nemoc: Floridští panteři jsou náchylní k různým nemocem, včetně kočičí leukémie, kočičí AIDS a psinky. Tyto nemoci se mohou přenést z domácích koček a psů na pantery a mohou způsobit vážné zdravotní problémy a dokonce i smrt.
Příbuzenské křížení: Vzhledem k malé velikosti populace floridských panterů je příbuzenská plemenitba významnou hrozbou pro jejich genetickou rozmanitost. Příbuzenské křížení může vést ke snížení reprodukčního úspěchu, zvýšené náchylnosti k nemocem a celkově ke snížení genetické zdatnosti.
Srážky vozidel: Floridští panteři často přecházejí silnice a dálnice při hledání potravy a území, což je činí náchylnými ke srážkám s vozidly. Tyto kolize mohou způsobit vážná zranění nebo smrt panterů.
Nezákonný obchod: Floridští panteři jsou někdy chyceni a nelegálně prodáváni jako exotická domácí zvířata nebo pro použití v cirkusech a jiných zábavních místech. Tento obchod představuje vážnou hrozbu pro přežití druhu.