Existují dvě teorie týkající se původu Chihuahua. Jedna teorie je, že pocházejí z malého psa zvaného Techchichi, který byl udržován civilizací Toltec v Mexiku. Druhou teorií je, že byli přivezeni do Mexika z Číny španělskými průzkumníky.
Podle American Kennel Club je však Chihuahua rodák z Mexika a nesouvisí s žádným jiným plemenem psů.