Ze žaludku se chyme přesune do tenkého střeva, což je nejdelší a nejsložitější část trávicího systému. Zde se většinu absorpce živin probíhá, když se chyme smíchá s trávicími enzymy produkovanými slinivem slinivky břišní, jako je amyláza, lipáza a proteáza a žluč produkované játry. Tyto enzymy rozkládají komplexní uhlohydráty, tuky a proteiny na jednoduché cukry, mastné kyseliny a aminokyseliny. Stěny tenkého střeva obsahují malé, prstové projekce nazývané villi, které zvyšují povrchovou plochu pro absorpci živin.
Nestrávený materiál zůstal po absorpci živin do tlustého střeva, který se skládá z tlustého střeva a konečníku. Tlusté střevo absorbuje vodu a elektrolyty a přeměňuje zbývající chym na pevný odpad. Rektum ukládá pevný odpad, dokud nebude možné z těla vyloučit anus během procesu defekace.