* Rumen: Skot má specializovaný žaludek nazývaný bachor, což je fermentační komora. Toto prostředí je do značné míry bez kyslíku, takže je ideální, aby se anaerobní bakterie dařilo.
* Zažívací procesy: Anaerobní bakterie hrají klíčovou roli při rozkládání složitého rostlinného materiálu, jako je celulóza, který konzumuje skot. Tento proces, známý jako fermentace, produkuje těkavé mastné kyseliny (VFA), které poskytují energii skotu.
* citlivost na kyslík: Zatímco některé aerobní bakterie mohou existovat ve střevech, jejich počet je výrazně nižší ve srovnání s anaerobními bakteriemi. Je to proto, že prostředí bachoru je chudé na kyslík a mnoho aerobních bakterií v takových podmínkách nemůže přežít.
Většina bakterií ve střevech skotu, zejména v bachoru, je proto anaerobní.