Genetická rozmanitost: Klonování produkuje geneticky identické jedince. Nedostatek genetické diverzity může způsobit, že populace bude náchylnější k nemocem, změnám životního prostředí a dalším hrozbám.
Behaviorální a ekologické dopady: Klonovaným zvířatům může chybět přirozené chování, sociální struktury a ekologické interakce vyvinuté po generace evoluce. To může narušit dynamiku ekosystému.
Konkurence a využití zdrojů: Zavedení klonovaných jedinců může zvýšit konkurenci o zdroje, jako je potrava, stanoviště a kamarádi, což ovlivňuje další druhy.
Přenos nemoci: Klonovaná zvířata mohou nést nemoci nebo genetické vady, které by se mohly rozšířit na divoké populace.
Vhodnost stanoviště: Klonovaná zvířata nemusí být dobře přizpůsobena specifickým podmínkám jejich přirozeného prostředí, což vede k nízké míře přežití.
Funkce ekosystému: Absence ekologických příspěvků klonovaných zvířat, jako je opylování, šíření semen nebo predace, může změnit fungování ekosystému.
Nedostatek přirozeného výběru: Klonování obchází přirozený výběr, což eliminuje méně přizpůsobené jedince. To může mít za následek vznik populace, která není vhodná pro dané prostředí.
Nepředvídatelné dlouhodobé účinky: Dlouhodobé ekologické důsledky klonování a zavádění geneticky identických zvířat do ekosystému nejsou zcela pochopeny.
I když se tedy klonování ohrožených druhů může zdát jako slibný nástroj ochrany, je třeba k němu přistupovat obezřetně a je nutný důkladný výzkum, který zhodnotí jeho potenciální rizika a dopady na ekosystémy.