* Vzhled: Kůže je domovem různých mikroorganismů, včetně bakterií, plísní a virů. Tyto mikroby pomáhají chránit pokožku před infekcí a poškozením a také hrají roli při regulaci teploty a vlhkosti pokožky.
* Dýchací cesty: Dýchací cesty jsou vystlány hlenem, který zachycuje mikroorganismy a brání jim v přístupu do plic. Některé mikroorganismy se však stále mohou dostat přes hlen a způsobit infekce, jako je zápal plic a bronchitida.
* Zažívací trakt: Trávicí trakt je domovem velkého množství mikroorganismů, včetně bakterií, hub a prvoků. Tyto mikroby pomáhají trávit potravu, absorbovat živiny a produkovat vitamíny. Hrají také roli při ochraně trávicího traktu před infekcí.
* Urogenitální trakt: Urogenitální trakt je domovem různých mikroorganismů, včetně bakterií, plísní a virů. Tyto mikroby mohou způsobit infekce, jako jsou infekce močových cest a pohlavně přenosné choroby.
* Krev: Krev je normálně sterilní, ale může se infikovat mikroorganismy, pokud dojde k porušení kůže nebo pokud je proveden lékařský zákrok.
U skotu:
* Bachor: Bachor je velký vakovitý orgán v žaludku krávy. Je domovem velké populace mikroorganismů, včetně bakterií, hub a prvoků. Tyto mikroby pomáhají rozkládat rostlinný materiál a přeměňovat jej na živiny, které kráva může absorbovat.
* Retikulum: Retikulum je malý voštinový orgán, který se nachází vedle bachoru. Obsahuje také velkou populaci mikroorganismů, které pomáhají rozkládat rostlinný materiál.
* Omasum: Omasum je třetí oddíl žaludku, který je zodpovědný za vstřebávání vody a živin z tráveniny. Obsahuje také populaci mikroorganismů, ale ne tolik jako bachor a retikulum.
* Abomasum: Slez je pravý žaludek krávy. Vylučuje trávicí enzymy, které štěpí bílkoviny a tuky. Neobsahuje mnoho mikroorganismů.
* Střeva: Střeva jsou zodpovědná za vstřebávání živin z tráveniny. Obsahují také populaci mikroorganismů, které pomáhají rozkládat živiny a produkovat vitamíny.
* Výkaly: Výkaly jsou odpadní produkty trávení. Obsahují velké množství mikroorganismů, včetně bakterií, hub a prvoků.