Epocha pleistocénu byla také časem megafauny nebo obří zvířata. Největší z těchto zvířat byl Mastodon, masivní příbuzný moderního slona, který mohl dosáhnout výšek až 13 stop a vážit až 8 tun. Mezi další Megafauna, která v té době žila v Kentucky
S oteplovacím podnebím na konci epochy pleistocénu tato zvířata postupně zanikla. Poslední mastodoni zmizeli ze Severní Ameriky asi před 11 000 lety, zatímco poslední mamuty vymřely asi před 10 000 lety.
Dnes je Kentucky domovem široké škály rostlin a zvířat, které jsou více přizpůsobeny současnému klimatu státu. V lesích dominují dubové, javorové a hickory stromy, zatímco pastviny jsou domovem různých trav, květin a keřů. Tundra zmizela z Kentucky, ale stát je stále domovem různých zvířat, která se vyskytují v chladnějším podnebí, jako je zajíc na sněžnicích, červená liška a jeleni s bílým ocasy.