Fretka s černými nohami je povinná masožravec, což znamená, že musí jíst maso, aby přežil. Zatímco jeho primárním zdrojem potravy jsou mladí prérie psi, mohou také jíst jiná malá zvířata, jako jsou veverky, kapesní gophers, klogaroo krysy a myši. Protože fretky s černými nohama loví vstupem do nory prérie psů, jejich preferovaná kořist, jejich strava se silně spoléhají na umístění a dostupnost prérijních psů.
