Jaguáři dávají přednost husté vegetaci s přístupem ke zdrojům vody, protože se jedná o kvalifikovaní plavci a často loví a pijí poblíž vodních útvarů. Zřizují domácí rozsahy, které se liší v závislosti na dostupnosti kořisti, ale rozsahy mužů mohou pokrýt několik set čtverečních kilometrů.
V rámci svých stanovišť hrají Jaguáři klíčové ekologické role jako nejlepší predátoři, což pomáhá udržovat rovnováhu ekosystému regulací populací kořisti. Jsou to osamělá zvířata a často zabírají stanoviště s různými druhy kořisti, jako jsou jeleny, peccarys, Capybaras, Tapirs a mnoho dalších.
Úsilí o ochranu Jaguarů zahrnuje zachování a ochranu jejich stanovišť, aby bylo zajištěno dlouhodobé přežití těchto nádherných a ekologicky důležitých predátorů kočičí.