Během procesu páření ukládá ženské mořské koně vejce do pouzdra mláďat na spodní straně břicha muže. Samec pak oplodňuje vejce a nese je, dokud nejsou připraveni vylíhnout, a poskytnout jim živiny a ochranu. Období těhotenství se liší mezi druhy mořských koní, ale může se pohybovat od několika týdnů do několika měsíců.
Jakmile se vejce vylíhnou, muž porodí živě mladým, které se nazývají „smažení“. Fry jsou plně formovány a nezávislé na narození a nedostávají od svých rodičů žádnou další péči. Muž i ženské mořské koně se mohou po celou dobu životnosti opakovat a reprodukovat několikrát.