Pstruh dýchá skrz žábry. Žábry jsou specializované orgány, které extrahují kyslík z vody. Jsou umístěny na obou stranách hlavy pstruha a jsou tvořeny tenkými, chmurnými vláknami. Každé vlákno je pokryto malými krevními cévami, které absorbují kyslík z vody. Když pstruh dýchá, přitahuje vodu do úst a projde ji přes žábry. Kyslík ve vodě je absorbován krevními cévami v žábrech a voda se pak vyloučí skrz štěrbiny pstruha. Pstruh pstruhů jsou velmi efektivní při extrakci kyslíku z vody a umožňují pstruhu dýchat i v relativně nízko-kyslíkovém prostředí.
