Šimpanze jsou obvykle černé nebo hnědé barvy, s některými světlejšími skvrnami na tváři, hrudi a břiše. Jejich srst je dlouhá a hrubá a pokrývá celé tělo s výjimkou jejich dlaní, chodidel a obličeje. Přesná barva šimpanze kožešiny se může lišit v závislosti na poddruhu, přičemž některé poddruhy jsou lehčí nebo tmavší než jiné.