1. Ztráta energie: Jak energie prochází potravním řetězcem, část se ztrácí jako teplo. To znamená, že pro organismy na vyšších trofických úrovních je k dispozici méně energie. Výsledkem je, že na každé následné trofické úrovni je méně organismů a potravní řetězec se zkracuje.
2. Soutěž: Organismy na každé trofické úrovni spolu soutěží o zdroje, jako je jídlo a prostor. Tato konkurence může omezit počet organismů, které mohou přežít na každé trofické úrovni, a může také vést k vyhynutí některých druhů.
3. Predace: Organismy na vyšších trofických úrovních jsou často kořistí organismy na nižších trofických úrovních. To může omezit počet organismů, které mohou dosáhnout vyšších trofických úrovní, a může také vést k vyhynutí některých druhů.
4. Faktory životního prostředí: Environmentální faktory, jako je změna klimatu, znečištění a ničení stanovišť, to vše může ovlivnit délku potravních řetězců. Tyto faktory mohou narušit tok energie a živin potravními řetězci a mohou vést k vyhynutí některých druhů.
V důsledku těchto faktorů jsou potravní řetězce obvykle krátké, pouze s několika trofickými úrovněmi. To znamená, že na vrcholu potravního řetězce je relativně málo organismů a že tyto organismy jsou často náchylné k vyhynutí.