Císaři tučňáci jsou mezi ptáky jedineční v tom, že muži jsou zodpovědní za inkubaci vajec. Ženy položí vejce a pak opustí kolonii, aby se živila na moři, a muži nechali vejce v teple přibližně dva měsíce, dokud se nevylíhnou. Samci se choulí ve skupinách, aby šetřili teplo a střídali se inkubací vejce na nohou, vyvažovali je na horní části nohou a zakryli je ochranným záhybem kůže.