Tropický mořský koník má ve své kůži vrstvu specializovaných buněk zvaných chromatofory. Chromatofory obsahují pigmentové granule, které mohou být dispergovány nebo koncentrovány za účelem změny barvy kůže. Mořský koník má také síť drobných svalů, které mohou ovládat pohyb chromatoforů. To umožňuje mořskému koníkovi rychle změnit barvu tak, aby odpovídala okolnímu korálu.
Kromě změny barvy může trpasličí mořský koník také změnit strukturu své kůže. Toho je dosaženo druhým typem specializované buňky zvané dermální papily. Dermální papily jsou malé, masité výběžky, které lze zvednout nebo snížit, aby se změnila struktura kůže. Zakrslý mořský koník používá toto přizpůsobení, aby odpovídalo struktuře korálů kolem něj, což ztěžuje predátorům jeho rozpoznání.
Schopnost trpasličího mořského koníka maskovat se je nezbytná pro jeho přežití. Umožňuje jim splynout s okolím a vyhnout se sežrání predátory. To je také užitečné, když loví kořist, protože mohou použít své maskování k přepadení své kořisti.